آزمایشگاه باکتری شناسی و مایکوباکتریولوژی در سال ۱۳۷۰ شروع بکار نموده است و فعالیتهای سه گانه طراحی و اجرای پروژه های تحقیقاتی، تربیت نیروهای متخصص و ارائه خدمات آزمایشگاهی تخصصی جهت بیماران زیر نظر اعضای هیات علمی مرکز انجام می شود .
هدف این فعالیتها پاسخگویی به نیازهای تحقیقاتی در زمینه بیماری های مرتبط با عفونتهای باکتریایی در ایران و منطقه، آموزش نیروهای کارآمد در این زمینه و ارائه خدمات آزمایشگاهی تخصصی باکتری شناسی برای پاسخگویی به نیازهای روزانه بیماران بستری و سرپایی می باشد. شناسایی هموفیلوس آنفلونزا نوع "ب" به عنوان شایعترین عامل مننژیت کودکان در مطالعه چند مرکزی در ایران که منجر به سیاستگذاری در کمیته واکسیناسیون کشوری برای اضافه شدن واکسن آن به برنامه واکسیناسیون کشوری شد از افتخارات این بخش می باشد. در راستای انجام همین طرح آقای دکتر نلسون نماینده ی سازمان بهداشت جهانی آزمایشگاه های این مرکز را به عنوان بهترین آزمایشگاه میکروبشناسی منطقه ی شرق مدیترانه (EMRO) معرفی نمود. انجام طرح پژوهشی عفونت مننگوکوک در حجاج وتوصیه جهت تجویز سیپروفلوکساسین به صورت دوز منفرد در زمان همه گیری از دستاوردهای دیگر این بخش می باشد.
دانشجویان در مقاطع کارشناسی ارشد و دکتری و نیز کارشناسان با تجربه در این مرکز زیر نظراعضای هیات عملی مرکز فعالیت می نماین. انجام خدمات مشاوره ای و آزمایشگاهی در چند مورد outbreak بیمارستانی به علت انتروکوکهای مقاوم به وانکومایسین در بیمارستانهای شیراز از تجربه های موفق اعضای هیات علمی آزمایشگاه باکتری شناسی می باشد.
الف – فعالیتهای پژوهشی
ب- فعالیتهای آموزشی و مشاوره ای
ج – ارایه خدمات آزمایشگاهی
